Samenvatting
Het jaar is Universal Century 0133. Tien jaar zijn verstreken sinds het gewapende verzet van de aristocratische fractie, de Crossbone Vanguard, werd onderdrukt. Tobia Aronnax is een uitwisselingsstudent aan boord van het ruimteschip Smashion naar Jupiter, maar tijdens een verraste aanval door een groep ruimtepiraten die zichzelf de Crossbone Vanguard noemen, komt hij erachter dat er eigenlijk verborgen agenda's waren onder degenen in de Smashion en in Jupiter zelf.
Nadat hij was gered door een lid van de piraten genaamd Kincaid Nau, werd hij aan boord van het piratenschip, de Mother Vanguard, gebracht en door de kapitein, Berah Ronah, overtuigd om zich bij hen aan te sluiten. De ware identiteit van de piratengroep bleek een guerrillagroep te zijn die zich verzette tegen de geheime fractie binnen Jupiter, het Jupiter-rijk, dat van plan is de aarde te veroveren. Nu moet Tobia een van de drie krachtige Crossbone Gundam besturen om deze nieuwe Crossbone Vanguard te helpen in hun zoektocht om de plannen van het Jupiterrijk te dwarsbomen.