Samengevat
Tokyo Babylon, een introspectieve, karaktergestuurde serie, leest als een manga-versie van The X-Files. Het verhaal - een moderne fantasie - volgt een jonge onmyouji (spiritueel medium) op zijn zoektocht om Tokio te beschermen tegen boze geesten.
Teenaged Subaru Sumeragi is het 13e hoofd van de Sumeragi-clan. Samen met zijn tweelingzus Hokuto en de mysterieuze dierenarts Seishirou reist Subaru door Tokio en kalmeert de geesten die de stad bedreigen.