Samengevat
Venus Versus Virus draait om het leven van de jonge meisjes genaamd Sumire Takahana en Lucia Nahashi, die elkaar ontmoetten toen Sumire op mysterieuze wijze Lucia's geheimen ontdekte bij de Venus Vanguard, een groep die op demonen jaagt genaamd "Virus" onder leiding van Lucia's geadopteerde vader Nahashi. Nu, terwijl ze banen aannemen van mensen die de Venus Vanguard-brochure vinden, bestrijden ze het "Virus" terwijl ze op zoek zijn naar hun ware wortels en motieven, en daarvoor vindt Lucia dat Sumire veel nuttiger kan zijn dan ze lijkt.