Samengevat
Op een dag reist een 23-jarige Japanse muzikant naar Mongolië om inspiratie op te doen voor het schrijven van een muziekstuk. Daar ontmoet hij Kanon wiens moeder het "Hotel Kanon" in de woestijn runt. Kanon groeide op in Mongolië, weet niet wie haar vader is en neemt hem voor dood zoals haar moeder haar dat vertelde. Dan sterft de moeder van Kanon die van een paard is gevallen aan een blessure. Voor haar dood vertelt ze haar dochter dat ze naar Mongolië is gekomen omdat ze niet in Japan kon blijven omdat ze een affaire had met Kanons vader, een muzikant, die eigenlijk nog leeft, en ze vraagt Kanon om hem in Japan te vinden door een vioolvirtuoos, maar sterft voordat hij haar zijn naam vertelt. Zo gaat Kanon met de jongeman naar Japan, waar ze leert musicus te worden in een muziekschool die wordt gerund door Mikami, een knappe jongeman en wereldwijd zeer succesvolle muzikant en dirigent. Al snel geeft de jongere zus van haar moeder haar foto's van drie muzikanten, van wie er één haar vader zou kunnen zijn. Kanons zoektocht naar haar vader begint ...