Het jaar is 2016 en glitches in het verleden van de mensheid bedreigen de duurzaamheid van haar toekomst. De Chaldea Security Organization - belast met het bewaren van de menselijke geschiedenis zo lang en zo sterk mogelijk - heeft een nieuwe methode van tijdreizen ontwikkeld om deze gebeurtenissen te herstellen en de toekomst van de mensheid te stabiliseren. Maar wanneer een onbekende bedreiging de mensheid op de rand van uitsterven brengt, staan jonge rekruten Mash Kyrielight en Ritsuka Fujimaru aan het roer van de reddingsmissie: Verkrijg de Heilige Graal in een confrontatie met het lot zelf ...
