Op de eerste schooldag deed Haruhi Suzumiya een aankondiging die iedereen verbaasde: “Ik heb geen interesse in gewone mensen. Als iemand hier een alien, tijdreiziger, schuifregelaar of esper is, kom dan alsjeblieft naar me toe! Dat is alles." Kyon, een volkomen normaal mens die toevallig de pech heeft om voor Haruhi aan het bureau te zitten, vroeg zich eerst af of ze een grapje maakte. Maar Haruhi Suzumiya is altijd serieus. Altijd. Kyon was in ieder geval nooit van plan om zich met haar capriolen bezig te houden. Maar wanneer een informeel gesprek Haruhi per ongeluk het idee geeft om een club te vormen die zich toelegt op het ontdekken en onderzoeken van mysterieuze verschijnselen, merkt Kyon dat hij al over zijn hoofd zit, vooral wanneer Haruhi hem haar eerste rekruut maakt. Andere leden van de club zijn onder meer Nagato Yuki, een rustig, schoolachtig meisje; Mikuru Asahina, een al te schattig meisje dat door Haruhi is uitgekozen om de "mascotte" van de club te zijn; en Koizumi Itsuki, een altijd glimlachende jongen die door Haruhi werd gekozen om de rol van "mysterieuze transferstudent" te spelen. En zo is de SOS Brigade geboren! Het wordt echter alleen maar vreemder en moeilijker voor Kyon als hij erachter komt dat de Haruhi zich onbewust heeft omringd met de mensen die ze al die tijd graag zou willen ontdekken: Nagato Yuki is eigenlijk een alien, Asahina Mikuru is een tijdreiziger en Koizumi Itsuki is een esper! En waarom zijn al deze mensen in de eerste plaats verschenen? Wel, voor Haruhi natuurlijk! Drie jaar geleden veroorzaakte Haruhi een soort van opschudding die elk van hen de moeite van het onderzoeken waard vindt. En Kyon, om wat voor reden dan ook, lijkt de enige "normale" in de hele groep te zijn. Zijn grootste vraag: waarom hij?
